1949年,王馥荔出生于江苏徐州市,是家中最小的一个孩子,12岁进入江苏省戏曲学校学花旦,十五,六岁时改学花旦和青衣。1967年,毕业于江苏省戏曲学校京剧科,“文革”开始后,王馥荔下放农场劳动,所学的第一件农活是种棉花,之后被分配到江苏省京剧团。20世纪70年代西哈努克来南京观看江苏省京剧团排演的样板戏《沙家浜》,但是饰演一号人物阿庆嫂的演员竟在当时失声,情急之下王馥荔临场救场,演出之后,王馥荔一举成为了剧团中的当家花旦。
王馥荔与丈夫王群在部队文工团工作认识并结婚,1978年5月4日儿子王骁在南京出生。
2008年5月12日,四川汶川8级特大地震自然灾害发生后,王馥荔慷慨解囊向灾区捐款5万。2015年6月10日,王馥荔在青岛参加了第十五届中国电影表演艺术学会奖颁奖典礼。